Naruto était un jeune shinobi avec un talent incorrigible pour le malice. Il a réalisé son rêve de devenir le plus grand ninja de son village, et maintenant son visage se trouve au sommet du monument Hokage. Mais ce n'est pas son histoire... Une nouvelle génération de ninja est prête à monter sur scène, dirigée par le propre fils de Naruto, Boruto

La VIe Grande Guerre Ninja n'est plus qu'un lointain souvenir et la paix s'est installée. Mais un ennemi ressemblant étrangement à Kaguya fait son apparition et s'attaque à Killer Bee... Sasuke enquête dans l'ombre et rentre pour prévenir Naruto du danger ! À Konoha, on prépare l'examen des ninjas pour passer ninja de moyenne classe. Boruto, le fils de Naruto, doit y participer en compagnie de Sarada et de Mitsuki. Boruto demande alors à Sasuke, le compagnon d'armes de son père, de le prendre comme disciple...